В научном отделе работают пять сотрудников, в т.ч. один кандидат биологических наук, три соискателя ученой степени кандидата биологических наук. Для исследований природных комплексов и биологического разнообразия по контракту приглашаются специалисты из академических институтов, ВУЗов Дальнего Востока, заповедников. Отчеты о проделанной работе предоставляются в ФГБУ «Заповедник «Бастак» и входят в Летопись природы.
В настоящее время сотрудниками заповедника проводятся исследования по следующим направлениям:
1. Динамика сезонных явлений и процессов в природном комплексе заповедника;
2. Состав, структура и динамика лесной растительности заповедника;
3. Исследования миграционных и демографических процессов орнитологического комплекса Еврейской автономной области;
4. Проведение комплексных мониторинговых работ за состоянием редких видов флоры и фауны заповедника «Бастак»;
5. Геоботаническое картирование территории заповедника;
6. Оптимизация территории заповедника «Бастак»;
7. Характеристика состава атмосферных взвесей по снегу.