Государственный природный заповедник «Бастак» представлен двумя кластерными участками: «Центральный» площадью 91771 га, который находится севернее города Биробиджан и «Забеловский» площадь которого составляет 36284 га, расположенный юго-восточнее пос. Смидович. Общая площадь заповедника «Бастак» – 128055 га.
В непосредственной близости от границ заповедной территории проходят крупные транспортные артерии: федеральная автомобильная дорога Москва-Владивосток и Транссибирская железнодорожная магистраль.
Территория заповедника почти поровну делится на горную и равнинную части.
В базе данных биоразнообразия заповедника «Бастак» включены 819 видов сосудистых растений, 721 вид водорослей, 518 видов лишайников, 150 видов мхов, 1001 вид грибов, 56 видов миксомицетов, 52 вида моллюсков, 2445 видов насекомых, 60 видов рыб, 7 видов земноводных, 4 вида пресмыкающихся, 272 вида птиц, 55 видов млекопитающих.